У 2401 році диван Кортес залишає космічну станцію, якував наприкінці своєї попередньої подорожі. Незабаром він виявляє, що знайдені ним кристали можуть привести в дію машину часу. Виявивши сліди діяльності TimeSplitter у різні періоди часу на Землі, Кортез сідає на машину часу та вирушає в ці періоди, боячись допомогти різним персонажам у їхніх битвах зі злом.

TimeSplitters: Future Perfect — шутер від першої особи, у якому гравці борються за свій шлях через тринадцяти сюжетних місій, розкиданих за шістьома тимчасовими періодами, поодинці або спільно. Арсенал головного героя варіюється залежно від періоду часу, у який він подорожує: наприклад, подорож 1924 рік дасть Кортесу володіти зброєю Першої світової війни; в радянській ситуації 1960-х років зберігається різне місцеве вогнепальна зброя того часу; етапи, які відбуваються в майбутньому, містять відповідну футуристичну зброю тощо.