Вантажопідйомність у півтори тонни дозволила успішно використовувати Unimog S як санітарний автомобіль (Krankenkraftwagen). Такі автомобілі будувалися з використанням стандартних закритих кузовів у різних варіантах. Інтер’єр кузовів можна було адаптувати для задоволення різних потреб – наприклад, для перевезення чотирьох нош з пацієнтами, або для поєднання нош і сидінь. Широкі двері в задній частині кузова полегшували процес завантаження нош всередину. Санітарні машини мали великі білі кола з червоними хрестами для полегшення ідентифікації – деталь, яка мала велике значення в контексті можливих військових операцій. Як і у випадку зі стандартними фургонами загального призначення, в процесі експлуатації з’явилися різні версії кузовів, з відмінностями в деталях даху, вікон і так далі.

Завдяки відмінній прохідності і хорошим експлуатаційним характеристикам ці автомобілі перебували на озброєнні Бундесверу протягом багатьох років. За різними оцінками, загальна кількість випущених санітарних автомобілів Unimog S 404 становить близько 2 000.