У Сан-Франциско вирвався на свободу вірус Пангу, він перетворює тисячі невинних людей у божевільних монстрів, які не відчувають болю і не бояться смерті. З кожною годиною вірус Пангу еволюціонує, породжуваючи все більше і більше жахливих мутації з однією-єдиною метою... Розширятися. 

Ви - капітан Вінтер, військовий офіцер, який бореться пліч-о-бок з Центром епідемічних досліджень і контролю. У вашому розпорядженні величезний арсенал і всі ресурси уряду США, і ви разом з ЦІК ні перед чим не зупиніться, щоб запобігти поширенню жахливого вірусу Пангу до обмежень, які виключають стримування, навіть якщо для цього доведеться пожертвувати цілі міста і мільйони життів.
  

• Гра Cepheus Protocol створена під впливом класичних стратегій в реальному часі, таких, як Company of Heroes and World in Conflict, а також і книжки « Мінірна війна Z».
• Якщо зможете, вціліть у смертельній сватці проти безжалісного ворога, який еволюціонує і стає сильнішим з кожним днем. 
• Створіть спеціальні юніти з різних базових елементів, які можна розмістити будь-де на карті типу « Відкритий світ ». 
• Бийтеся з зараженими вірусами Пангу на чотирьох островах, як, наприклад, « відкритий світ», які містять унікальні складні локації.
• Виберіть один з трьох бойових рівнів і грайте в стилі, який вам подобається. У кожного рівня є спеціальні юніти, спорядження і зброя. 
• Схлестіться з безжалісною ордою заражених, чисельність і сила яких росте з кожною захопленою територією, і б'йтеся за контроль над Сан-Франциско.
• Шукайте Нульову пацієнтку, яка носиться по місту, захоплюючи територію. Кожна завойована зона збільшує її царство, оскільки вірус поширюється і захоплює цілий орган.
• Створіть альянс або об'єднайтеся проти фракцій анархістів і поліції, які борються за своє існування серед божевілля, яке охопило Сан-Франциско.