Главный герой игры - агент ЦРУ под прикрытием Рико Родригес - пытается свергнуть коррумпированное правительство южно-американского острова Сан-Эсперито, угрожающего всему цивилизованному миру. Just Cause не настаивает на последовательном выполнении всех до единой миссий - игрок может идти к своей цели как ему захочется: сталкивать две враждующие группировки друг с другом, поднимать восстание народных масс или прибегать к помощи наркокартелей. Мир Just Cause простирается аж на 1225 квадратных миль, а его просторы заполнены джунглями, пляжами, городами и деревеньками. По всему этому великолепию игрок сможет путешествовать на различных транспортных средствах - как наземных, так и воздушных и даже водных.

Масштабы Just Cause просто завораживают: для того, чтобы пройти из одной части острова в другую вам придется потратить более 40 минут чистого времени - это с учетом того, что вы не будете отвлекаться на окружающие красоты и выполнение заданий, которых в игре будет не менее 300. Вы сами вольны решать, каким образом себя вести и в какой последовательности выполнять поставленные самим же собой задачи.