NieR: Automata рассказывает историю андроидов 2B, 9S и A2 и их борьбу за восстановление контроля над дистопией, захваченной мощными машинами.

Человечество было изгнано с Земли механическими существами из другого мира. В последней попытке вернуть планету, человеческое сопротивление отправляет армию солдат-андроидов, чтобы уничтожить захватчиков. Теперь между машинами и андроидами идет война... Война, которая вскоре может раскрыть давно забытую правду о мире.