Особливістю кулера для корпуса Noctua NF-S12A PWM є можливість управління швидкістю за допомогою ШІМ при роботі від стандартного чотирьох-контактного роз'єму, реалізована силами фірмової мікросхеми Noctua NE-FD1. Вентилятор поміщений в пластикову рамку, забезпечений антивібраційними прокладками і обладнаний самостабілізується масляним підшипником (SSO2), розрахованим в середньому на 150 000 годин безвідмовної роботи. На семи лопатях крильчатки присутні особливі напливи Anti-Stall Knobs, які повинні перешкоджати зупинці вентилятора при функціонуванні на малих обертах. Максимальна швидкість обертання становить 1200 обертів на хвилину при рівні шуму 17.8 дБ.