Досить поширений неправильний спосіб застосування червоних перців в кулінарії. Багато вживають їх як приправу, а не як пряність, тобто додають до вже готового блюда, яке «перчать», замість того, щоб вводити під час приготування страви, принаймні за кілька хвилин до його остаточної готовності (зазвичай від 5 до 10 хвилин).
Червоні перці вживаються переважно в м'ясні, овочеві та рисові страви, починаючи від салатів, супів і борщів і кінчаючи тушкованим м'ясом, овочами та їх поєднаннями з рисом. Особливо корисно і приємно додавати червоний перець в меленому вигляді в різні овочеві пюре (картопля, помідори, бруква, ріпа, морква, горох, баклажани, кабачки); при цьому перець треба поєднувати з часником, коріандром, базиліком, чабером, лавровим порошком — це урізноманітнює стіл і надає різні смакові «звучання» добре відомим і одноманітним страв (наприклад, картопляного пюре).
У набагато меншій кількості, ніж в овочеві страви, червоний перець можна додавати в рибні супи і страви з відвареної риби, причому в останньому випадку не безпосередньо, а в складі відповідного соусу, в якому іншими компонентами можуть виступати мускатний горіх, чебрець, цибуля, кріп, фенхель, петрушка. Взагалі в соусах червоний перець вживається у вигляді гострого початку, причому поряд з тими прянощами, у яких більш розвинений аромат, а не пекучість. Червоний перець надає соусам не тільки пекучість, але і красивий колір, особливо паприка; пігментне початок паприки виражено сильніше, так як на її приготування йде виключно оболонка червоного перцю, без насіння і внутрішніх перегородок стручка.
Червоний перець входить також у всі види сильно пекучих каррі і в більшість інших пряних сумішей. Менш поширене його вживання при приготуванні смаженої домашньої птиці, хоча він надає їй пікантність, відбиває специфічний курячий запах (в таких випадках він вживається в поєднанні з бадьяном і часником за 15 хвилин до готовності страви).